Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930595D18RikD3Z642 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930595D18RikD3Z642 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms