Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12cD3Z3L3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim12cD3Z3L3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms