Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms