Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5930D3Z257 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5930D3Z257 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5930D3Z257 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms