Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem200bD3Z0P8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms