Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed7D3YZZ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed7D3YZZ5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed7D3YZZ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms