Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CatipB9EKE5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CatipB9EKE5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CatipB9EKE5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CatipB9EKE5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CatipB9EKE5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CatipB9EKE5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CatipB9EKE5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CatipB9EKE5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CatipB9EKE5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CatipB9EKE5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms