Protein–RNA interactions for Protein: B7ZNG4

Troap, Tastin, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroapB7ZNG4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TroapB7ZNG4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TroapB7ZNG4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TroapB7ZNG4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms