Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Siah3B2RWG3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah3B2RWG3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms