Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap58B2RW38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap58B2RW38 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms