Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rd3lB2RV38 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.8 ms