Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc8B2RUS7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Abcc8B2RUS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Abcc8B2RUS7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms