Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf3B2RUQ2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms