Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apol7aB2RT54 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms