Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf3B2RQG2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms