Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3aB1AWZ3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap3aB1AWZ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms