Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbc1d2B1AVH7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms