Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NhsB1AV60 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NhsB1AV60 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NhsB1AV60 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NhsB1AV60 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NhsB1AV60 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NhsB1AV60 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NhsB1AV60 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms