Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skint2A7XUX6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms