Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms