Protein–RNA interactions for Protein: A6X8I0

Gm1993, Predicted gene 1993, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1993A6X8I0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm1993A6X8I0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm1993A6X8I0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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