Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4A4UUI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4A4UUI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp4A4UUI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp4A4UUI3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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