Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Btbd35f28A2CFD5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Btbd35f28A2CFD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Btbd35f28A2CFD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Btbd35f28A2CFD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Btbd35f28A2CFD5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Btbd35f28A2CFD5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Btbd35f28A2CFD5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Btbd35f28A2CFD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Btbd35f28A2CFD5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Btbd35f28A2CFD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Btbd35f28A2CFD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Btbd35f28A2CFD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Btbd35f28A2CFD5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms