Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Upf2A2AT37 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms