Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pramef17A2ASJ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramef17A2ASJ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.2 ms