Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn3aA2ASI5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms