Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rtf1A2AQ19 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rtf1A2AQ19 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms