Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttll9A2APC3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms