Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SetxA2AKX3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SetxA2AKX3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms