Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem185aA2AF53 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem185aA2AF53 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms