Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyb561d1A2AE42 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms