Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm16A2A935 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm16A2A935 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm16A2A935 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms