Protein–RNA interactions for Protein: A2A7W1

Cd300ld4, CD300 molecule-like family member D4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld4A2A7W1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd300ld4A2A7W1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300ld4A2A7W1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld4A2A7W1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms