Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc112A0AUP1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc112A0AUP1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms