Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv4A0A075B5I2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv4A0A075B5I2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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