Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms