Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SrfQ9JM73 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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