Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rabgef1Q9JM13 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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