Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Upk3aQ9JKX8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms