Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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