Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms