Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rrp8Q9DB85 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rrp8Q9DB85 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rrp8Q9DB85 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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