Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms