Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Zfp819-202ENSMUST00000116324 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rpl6l-201ENSMUST00000171120 871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Cib3-201ENSMUST00000098630 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Fank1-202ENSMUST00000121560 475 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm42441-201ENSMUST00000199778 748 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdh23Q99PF4 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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