Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp1b4Q99ME6 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.4 ms