Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp16Q99LG0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp16Q99LG0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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