Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms