Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms