Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg16l1Q8C0J2 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms