Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
ChfrQ810L3 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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